Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms