Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA3Q8TBC4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA3Q8TBC4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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