Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM58Q8NG06 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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