Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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