Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RNF169Q8NCN4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF169Q8NCN4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RNF169Q8NCN4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RNF169Q8NCN4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RNF169Q8NCN4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF169Q8NCN4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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