Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC63Q8NA47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms