Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms