Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3Q8N5Y2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3Q8N5Y2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms