Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf62Q8N4C0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms