Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms