Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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