Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms