Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUP54Q7Z3B4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms