Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX7Q7RTT5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX7Q7RTT5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms