Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms