Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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