Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A48Q6ZT89 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A48Q6ZT89 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms