Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms