Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIAT1Q6ZQX7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIAT1Q6ZQX7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms