Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPOCD1Q6ZMY3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms