Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms