Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP12Q6UXS9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms