Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms