Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms