Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A47Q6Q0C1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A47Q6Q0C1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms