Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms