Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF40BQ6NWY9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms