Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms