Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms