Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC181Q5TID7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC181Q5TID7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms