Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HES3Q5TGS1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HES3Q5TGS1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms