Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDGFL1Q5TGJ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms