Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms