Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms