Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC3LQ587J8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KHDC3LQ587J8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms