Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ANKRD39Q53RE8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms