Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms