Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRNQ4KMQ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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