Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms