Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UVSSAQ2YD98 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UVSSAQ2YD98 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms