Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TSNAXIP1Q2TAA8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNAXIP1Q2TAA8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms