Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms