Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms