Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC27Q2M243 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms