Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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