Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FSCN1Q16658 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FSCN1Q16658 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms