Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NFE2Q16621 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFE2Q16621 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFE2Q16621 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFE2Q16621 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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