Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTF1Q16619 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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