Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACKR1Q16570 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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