Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN1Q16512 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN1Q16512 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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